Significado y Definición de Oligonucleótido

Un oligonucleótido es una cadena corta de moléculas de ADN o ARN que tiene muchos usos en biología molecular y medicina. Se utiliza como sonda para rastrear enfermedades, infecciones virales e identificar genes en experimentos de biología molecular.

También se usa como cebador en un tipo de secuenciación de ADN.

Para comprender un oligonucleótido, ayuda a comprender la estructura del ADN. Las moléculas de ADN son bobinas muy largas de dos cadenas, compuestas de cuatro unidades básicas de nucleótidos diferentes, organizadas en diferentes órdenes. Cada unidad tiene una base complementaria que se conectará, por lo que cada cable tiene un conjunto opuesto de bases que lo conectan.

Estas bases pueden formar una amplia variedad de combinaciones diferentes, y es la combinación de bases la que proporciona el código genético. El ADN se transcribe para producir ARN mensajero (ARNm), que luego se traduce para producir proteínas.

Los oligonucleótidos se identifican por su longitud de cadena. Por ejemplo, un oligonucleótido con diez bases de nucleótidos se llamaría diez mer .

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Por lo general, se sintetizan químicamente, y el tipo de síntesis limita la longitud de la cadena a menos de 60 bases.

En un tipo de secuenciación de ADN conocida como secuenciación didesoxi , los oligonucleótidos se usan como cebador, por lo que la enzima que produce el ADN tendrá un modelo con el que trabajar. Se usa ADN monocatenario y se sintetiza un oligonucleótido que es complementario a la cadena de ADN usando una máquina automatizada.

La ADN polimerasa que sintetiza ADN continúa añadiéndose al cebador y sintetiza la cadena opuesta de ADN. Esta reacción produce ADN bicatenario.

Un uso más reciente de oligonucleótidos como cebadores es en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) que se usa para amplificar pequeños fragmentos de ADN. Esta técnica tiene usos muy prácticos, como en las pruebas forenses y de paternidad.

También revolucionó la investigación en medicina y ciencias biológicas, ya que a menudo se usa en experimentos de ingeniería genética.

A menudo se usa una serie de sondas de oligonucleótidos para aislar genes de una biblioteca de genes o ADN complementarios (ADNc). Las bibliotecas de CDNA consisten en ADN bicatenario, en el que una cadena se deriva de una cadena de ARNm y la otra es complementaria a ella. Dichas bibliotecas tienen la ventaja de no tener las lagunas que a menudo se encuentran en los genes de los organismos superiores.

La estructura genética de muchos organismos es conocida debido a los proyectos de secuenciación y está disponible para el público. Si alguien quiere clonar un gen de otro organismo, puede ver lo que se sabe sobre el gen en otros organismos y diseñar sondas basadas en áreas comunes en esas secuencias.

Luego, los investigadores tienen una serie de sondas de oligonucleótidos sintetizadas que tienen en cuenta las posibles variaciones en el área común. Escanean la biblioteca con estas sondas y buscan oligonucleótidos de unión. Muchos genes han sido identificados de esta manera.

Un oligonucleótido antisentido contiene una sola cadena de ARN o ADN que complementa una secuencia de interés. Una vez que se clona un gen específico que codifica una proteína, a menudo se usa ARN antisentido para bloquear su expresión uniéndose al ARNm que lo sintetizaría.

Esto permite a los investigadores determinar los efectos en el cuerpo cuando no produce esta proteína. Los oligonucleótidos antisentido también se están desarrollando como nuevos tipos de fármacos para bloquear los ARN tóxicos.

Los chips de microarrays fueron otra área donde los oligonucleótidos fueron de gran utilidad. Son portaobjetos de vidrio, o alguna otra matriz, que tienen manchas que contienen miles de sondas de ADN diferentes, en este caso, hechas de oligonucleótidos.

Son una forma muy eficiente de probar cambios en varios genes diferentes al mismo tiempo. El ADN está unido a un compuesto que cambia de color, o fluorescente, si el ADN complementario se une a él; por lo tanto, las manchas cambian de color si hay una reacción con el ADN de prueba.

Algunas de las cosas para las que se utilizan microarrays de oligonucleótidos incluyen la detección de enfermedades genéticas. Por ejemplo, hay pequeñas sondas que representan la actividad de los genes involucrados en el cáncer de mama, BRCA1 y BRCA2 .

Es posible averiguar si una mujer tiene una mutación en uno de estos genes y analizarla más a fondo para ver si está predispuesta al cáncer de seno.

Hay un microarray llamado ViroChip que tiene sondas para aproximadamente 20,000 genes de varios virus patógenos que han sido secuenciados.

Las secreciones corporales, como la flema, se pueden analizar con el chip, que generalmente puede identificar con qué tipo de virus está infectada una persona. Identificar infecciones virales puede ser bastante difícil, ya que los síntomas generalmente son similares a los diferentes tipos de virus.

que es oligonucleótido